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Archivio istituzionale della ricerca dell'Università degli Studi di Palermo
To identify novel genes associated with ALS, we undertook two lines of investigation. We carried out a genome-wide association study comparing 20,806 ALS cases and 59,804 controls. Independently, we performed a rare variant burden analysis comparing 1,138 index familial ALS cases and 19,494 controls. Through both approaches, we identified kinesin family member 5A (KIF5A) as a novel gene associated with ALS. Interestingly, mutations predominantly in the N-terminal motor domain of KIF5A are causative for two neurodegenerative diseases: hereditary spastic paraplegia (SPG10) and Charcot-Marie-Tooth type 2 (CMT2). In contrast, ALS-associated mutations are primarily located at the C-terminal cargo-binding tail domain and patients harboring loss-of-function mutations displayed an extended survival relative to typical ALS cases. Taken together, these results broaden the phenotype spectrum resulting from mutations in KIF5A and strengthen the role of cytoskeletal defects in the pathogenesis of ALS.
Nicolas A., Kenna K.P., Renton A.E., Ticozzi N., Faghri F., Chia R., et al. (2018). Genome-wide Analyses Identify KIF5A as a Novel ALS Gene. NEURON, 97(6), 1268-1283.e5 [10.1016/j.neuron.2018.02.027].
Genome-wide Analyses Identify KIF5A as a Novel ALS Gene
Nicolas A.;Kenna K. P.;Renton A. E.;Ticozzi N.;Faghri F.;Chia R.;Dominov J. A.;Kenna B. J.;Nalls M. A.;Keagle P.;Rivera A. M.;van Rheenen W.;Murphy N. A.;van Vugt J. J. F. A.;Geiger J. T.;Van der Spek R. A.;Pliner H. A.;Shankaracharya;Smith B. N.;Marangi G.;Topp S. D.;Abramzon Y.;Gkazi A. S.;Eicher J. D.;Kenna A.;Logullo F. O.;Simone I. L.;Logroscino G.;Salvi F.;Bartolomei I.;Borghero G.;Murru M. R.;Costantino E.;Pani C.;Puddu R.;Caredda C.;Piras V.;Tranquilli S.;Cuccu S.;Corongiu D.;Melis M.;Milia A.;Marrosu F.;Marrosu M. G.;Floris G.;Cannas A.;Capasso M.;Caponnetto C.;Mancardi G.;Origone P.;Mandich P.;Conforti F. L.;Cavallaro S.;Mora G.;Marinou K.;Sideri R.;Penco S.;Mosca L.;Lunetta C.;Pinter G. L.;Corbo M.;Riva N.;Carrera P.;Volanti P.;Mandrioli J.;Fini N.;Fasano A.;Tremolizzo L.;Arosio A.;Ferrarese C.;Trojsi F.;Tedeschi G.;Monsurro M. R.;Piccirillo G.;Femiano C.;Ticca A.;Ortu E.;La Bella V.;Spataro R.;Colletti T.;Sabatelli M.;Zollino M.;Conte A.;Luigetti M.;Lattante S.;Santarelli M.;Petrucci A.;Pugliatti M.;Pirisi A.;Parish L. D.;Occhineri P.;Giannini F.;Battistini S.;Ricci C.;Benigni M.;Cau T. B.;Loi D.;Calvo A.;Moglia C.;Brunetti M.;Barberis M.;Restagno G.;Casale F.;Marrali G.;Fuda G.;Ossola I.;Cammarosano S.;Canosa A.;Ilardi A.;Manera U.;Grassano M.;Tanel R.;Pisano F.;Mazzini L.;Messina S.;D'Alfonso S.;Corrado L.;Ferrucci L.;Harms M. B.;Goldstein D. B.;Shneider N. A.;Goutman S. A.;Simmons Z.;Miller T. M.;Chandran S.;Pal S.;Manousakis G.;Appel S. H.;Simpson E.;Wang L.;Baloh R. H.;Gibson S. B.;Bedlack R.;Lacomis D.;Sareen D.;Sherman A.;Bruijn L.;Penny M.;Moreno C. D. A. M.;Kamalakaran S.;Allen A. S.;Boone B. E.;Brown R. H.;Carulli J. P.;Chesi A.;Chung W. K.;Cirulli E. T.;Cooper G. M.;Couthouis J.;Day-Williams A. G.;Dion P. A.;Gitler A. D.;Glass J. D.;Han Y.;Harris T.;Hayes S. D.;Jones A. L.;Keebler J.;Krueger B. J.;Lasseigne B. N.;Levy S. E.;Lu Y. -F.;Maniatis T.;McKenna-Yasek D.;Myers R. M.;Petrovski S.;Pulst S. M.;Raphael A. R.;Ravits J. M.;Ren Z.;Rouleau G. A.;Sapp P. C.;Sims K. B.;Staropoli J. F.;Waite L. L.;Wang Q.;Wimbish J. R.;Xin W. W.;Phatnani H.;Kwan J.;Broach J.;Arcila-Londono X.;Lee E. B.;Van Deerlin V. M.;Fraenkel E.;Ostrow L. W.;Baas F.;Zaitlen N.;Berry J. D.;Malaspina A.;Fratta P.;Cox G. A.;Thompson L. M.;Finkbeiner S.;Dardiotis E.;Hornstein E.;MacGowan D. J. L.;Heiman-Patterson T.;Hammell M. G.;Patsopoulos N. A.;Dubnau J.;Nath A.;Musunuri R. L.;Evani U. S.;Abhyankar A.;Zody M. C.;Kaye J.;Wyman S. K.;LeNail A.;Lima L.;Rothstein J. D.;Svendsen C. N.;Van Eyk J. E.;Maragakis N. J.;Kolb S. J.;Cudkowicz M.;Baxi E.;Benatar M.;Taylor J. P.;Wu G.;Rampersaud E.;Wuu J.;Rademakers R.;Zuchner S.;Schule R.;McCauley J.;Hussain S.;Cooley A.;Wallace M.;Clayman C.;Barohn R.;Statland J.;Swenson A.;Jackson C.;Trivedi J.;Khan S.;Katz J.;Jenkins L.;Burns T.;Gwathmey K.;Caress J.;McMillan C.;Elman L.;Pioro E. P.;Heckmann J.;So Y.;Walk D.;Maiser S.;Zhang J.;Silani V.;Gellera C.;Ratti A.;Taroni F.;Lauria G.;Verde F.;Fogh I.;Tiloca C.;Comi G. P.;Soraru G.;Cereda C.;De Marchi F.;Corti S.;Ceroni M.;Siciliano G.;Filosto M.;Inghilleri M.;Peverelli S.;Colombrita C.;Poletti B.;Maderna L.;Del Bo R.;Gagliardi S.;Querin G.;Bertolin C.;Pensato V.;Castellotti B.;Camu W.;Mouzat K.;Lumbroso S.;Corcia P.;Meininger V.;Besson G.;Lagrange E.;Clavelou P.;Guy N.;Couratier P.;Vourch P.;Danel V.;Bernard E.;Lemasson G.;Laaksovirta H.;Myllykangas L.;Jansson L.;Valori M.;Ealing J.;Hamdalla H.;Rollinson S.;Pickering-Brown S.;Orrell R. W.;Sidle K. C.;Hardy J.;Singleton A. B.;Johnson J. O.;Arepalli S.;Polak M.;Asress S.;Al-Sarraj S.;King A.;Troakes C.;Vance C.;de Belleroche J.;ten Asbroek A. L. M. A.;Munoz-Blanco J. L.;Hernandez D. G.;Ding J.;Gibbs J. R.;Scholz S. W.;Floeter M. K.;Campbell R. H.;Landi F.;Bowser R.;Kirby J.;Pamphlett R.;Gerhard G.;Dunckley T. L.;Brady C. B.;Kowall N. W.;Troncoso J. C.;Le Ber I.;Heiman-Patterson T. D.;Kamel F.;Van Den Bosch L.;Strom T. M.;Meitinger T.;Shatunov A.;Van Eijk K. R.;de Carvalho M.;Kooyman M.;Middelkoop B.;Moisse M.;McLaughlin R. L.;Van Es M. A.;Weber M.;Boylan K. B.;Van Blitterswijk M.;Morrison K. E.;Basak A. N.;Mora J. S.;Drory V. E.;Shaw P. J.;Turner M. R.;Talbot K.;Hardiman O.;Williams K. L.;Fifita J. A.;Nicholson G. A.;Blair I. P.;Esteban-Perez J.;Garcia-Redondo A.;Al-Chalabi A.;Al Kheifat A.;Andersen P. M.;Chio A.;Cooper-Knock J.;Dekker A.;Redondo A. G.;Gotkine M.;Hide W.;Iacoangeli A.;Kiernan M.;Landers J. E.;Mill J.;Neto M. M.;Pardina J. M.;Newhouse S.;Pinto S.;Pulit S.;Robberecht W.;Shaw C.;Sproviero W.;Tazelaar G.;Van Damme P.;van den Berg L. H.;van Vugt J.;Veldink J. H.;Zatz M.;Bauer D. C.;Twine N. A.;Rogaeva E.;Zinman L.;Brice A.;Feldman E. L.;Ludolph A. C.;Weishaupt J. H.;Trojanowski J. Q.;Stone D. J.;Tienari P.;Chio A.;Shaw C. E.;Traynor B. J.
2018-01-01
Abstract
To identify novel genes associated with ALS, we undertook two lines of investigation. We carried out a genome-wide association study comparing 20,806 ALS cases and 59,804 controls. Independently, we performed a rare variant burden analysis comparing 1,138 index familial ALS cases and 19,494 controls. Through both approaches, we identified kinesin family member 5A (KIF5A) as a novel gene associated with ALS. Interestingly, mutations predominantly in the N-terminal motor domain of KIF5A are causative for two neurodegenerative diseases: hereditary spastic paraplegia (SPG10) and Charcot-Marie-Tooth type 2 (CMT2). In contrast, ALS-associated mutations are primarily located at the C-terminal cargo-binding tail domain and patients harboring loss-of-function mutations displayed an extended survival relative to typical ALS cases. Taken together, these results broaden the phenotype spectrum resulting from mutations in KIF5A and strengthen the role of cytoskeletal defects in the pathogenesis of ALS.
Nicolas A., Kenna K.P., Renton A.E., Ticozzi N., Faghri F., Chia R., et al. (2018). Genome-wide Analyses Identify KIF5A as a Novel ALS Gene. NEURON, 97(6), 1268-1283.e5 [10.1016/j.neuron.2018.02.027].
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
