Archivio istituzionale della ricerca dell'Università degli Studi di Palermo
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EnglishGene expression microarrays allow a researcher to measure the simultaneous response of thousands of genes to external conditions. Affymetrix GeneChipr expression array technology has become a standard tool in medical research. Anyway, a preprocessing step is usually necessary in order to obtain a gene expression measure. Aim of this paper is to propose a calibration method to estimate the nominal concentration based on a non-linear mixed model. This method is an enhancement of a method proposed in Mineo et al. (2006). The relationship between raw intensities and concentration is obtained by using the Langmuir isotherm theory.
| Autori: | Mineo, A.; Augugliaro, L.; Fede, C.; Ruggieri, M. |
| Titolo: | A Statistical Calibration Method based on Non-Linear Mixed Model for Affymetrix Probe Level Data |
| Nome del convegno: | CLADAG2007 |
| Luogo del convegno: | Macerata |
| Anno del convegno: | 12-14 Settembre 2007 |
| Data di pubblicazione: | 2007 |
| Citazione: | Mineo, A., Augugliaro, L., Fede, C., & Ruggieri, M. (2007). A Statistical Calibration Method based on Non-Linear Mixed Model for Affymetrix Probe Level Data. In Cssification and Data Analysis Group - Book of Short Papers (pp.97-100). MACERATA : EUM Edizioni Università di Macerata. |
| Tipologia: | 0 - Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) |
| Appare nelle tipologie: | 0 - Proceedings (TIPOLOGIA NON ATTIVA) |
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